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镇江检验检疫局是江苏检验检疫局的分支机构,实行垂直领导的管理体制,依据《中华人民共和国进出口商品检验法》《中华人民共和国进出境动植物检疫法》《中华人民共和国国境卫生检疫法》《中华人民共和国食品安全法》以及相关条例对镇江地区的进出口商品所涉及的安全、卫生、环保和反欺诈等方面进行检验鉴定和监督管理,对出入境人员交通工具、集装箱等进行卫生检疫、传染病监测和卫生监督,对进出境动植物进行检疫,以保护人民群众的身体健康和安全,保护动植物的健康和安全,保护环境,防止欺诈行为,维护国家安全。
在镇江港、丹阳和镇江新区设立三个副处级办事处机构,在句容、扬中设立报检签证点,镇江地区检验检疫业务实现了产地——口岸——陆路的多点延伸。