1935年1月，遵义会议结束了王明“左”倾教条主义的错误领导，开始了以毛泽东为代表的正确路线的领导。会后，党中央和毛泽东于2月13日给中央苏区分局发来电报，指出：“放在你们面前的任务是坚持游击战争”，用它“坚韧地顽强地反对敌人的堡垒主义与清剿政策”。“应该承认中区（即中央苏区的简称——引者）目前环境的严重性”，“对游击战争的坚持性不足是最大的危险”。因此，必须“立即改变组织方式和斗争方式，使之与游击战争环境相适应”。“短小精干是目前的原则”。“庞大的机关应立即缩小或取消，负责人应随游击队行动”。

　　据瑞金市党史部门提供的资料，遵义会议后不久，毛泽覃根据中央分局的统一安排，率领一部前往福建长汀的四都区，与福建省委书记万永诚、军区司令员龙腾云率领的队伍会合整编，成立新的闽赣边界军区领导机构，毛泽覃是军区的领导成员。1935年二三月间，国民党又发动了第二次“清剿”，福建省级机关在四都也无法留驻了，先后搬迁到谢坊、琉璃、汤屋、小金、乌泥等小村庄。毛泽覃根据党中央和毛泽东的指示，曾经建议“放弃四都，将部队编成几个支队，四处袭击敌人，领导中心退到闽粤赣边的深山中去”。可是，万永诚却拒绝接受，结果两个主力团反而被敌人打散。

　　4月上旬，部队在长汀县腊口西分水坳被敌人包围，龙腾云、万永诚率领大部分队伍向东突围，毛泽覃率领一部分队伍担任掩护，然后向西突围。龙腾云、万永诚突围后，第二天在武平县梅子坝又被敌人包围，部队打散，龙、万在战斗中牺牲。毛泽覃率领一部分队伍完成掩护任务后，突出重围，到达田心，不料又遭敌伏击，队伍被打散。他迅速收集部分被打散的战士，摆脱尾追敌人，经过艰苦转战，来到长汀和瑞金边界的大山之中。

　　1935年4月25日，毛泽覃率领饥寒交迫的游击队穿山越岭，来到瑞金县黄鳝口附近一个名叫“红林”的大山之中。这天傍晚，他们来到高山上只有几户人家的黄田坑，晚上在老乡的帮助下，来到一个纸槽里过夜。深夜，毛泽覃把一个姓杨的战士叫到跟前，指示他说：“你到杉背坑去找陶古游击队，请他们明天到这儿来，一起攻打国民党的黎子岗炮楼，我们从那儿冲出去。”清晨，他又叫醒一个姓何的战士，派他出去侦查敌情。这时，敌毛炳文部二十四师汤团某部，在排长兼便衣队长秦坤的带领下，路过这里，发现草丛里躺着一个人，立即围拢上去。那个姓何的战士不及鸣枪报警就当了敌人的俘虏，供出在纸槽小屋里还有十几个人，十几条枪，其中有一个姓毛的司令。

　　敌人很快就包围了小屋。听到枪声，毛泽覃立即命令突围，他担任掩护。激战中，一颗子弹穿进毛泽覃的前胸。毛泽覃牺牲后，敌人从他身上搜出了染血的毛泽东和朱总司令的照片，还有入党证。